מרכז בקדושה מהווה קורת גג לכל לתחומי החינוך והטיפול בהתבגרות, זוגיות, משפחה, אינטימיות, ומיניות בריאה.

המרכז משמש ככתובת מוסמכת לכל נושאי: התמודדויות בגיל ההתבגרות, הנחיית הורים, חינוך לאינטימיות בריאה, יעוץ זוגי, יעוץ וטיפול מיני, העצמה אישית ומשפחתית, טראומות ופגיעות מיניות, התמכרויות, משיכה תוך מגדרית ועוד.

במרכז קיימים שני אגפים: בית הספר ללימודי משפחה – שורש וענף, ואגף טיפולי – בקדושה,

מגוון רחב של פעילויות מתבצעים באגפים אלו: סדנאות להורים ולצוותי חינוך, קורסים והשתלמויות, קו סיוע, הכוונה לטיפול וצוות מטפלים מומחים. מרכז בקדושה משלב אנשי רוח, אנשי חינוך, אנשי ייעוץ, מטפלים וחוקרים מדיסציפלינות שונות: חינוך, רפואה ובריאות הנפש, והכל מתוך אחריות מקצועית ותורנית.

המרכז מלווה מוסדות וארגונים ומסייע למשפחות זוגות ויחידים.